Abstracts


Area: Computational Biochemistry and Biophysics


 C-001 - THE HOST/GUEST INTERACTIONS OF THE KEY PROTEIN FOR THE BIPOLAR DISORDER
Schultz, L.G. (UNICAMP - Universidade Estadual de Campinas ) ; Villalta-Romero, F.G. (UNICAMP - Universidade Estadual de Campinas CNPTIA - Embrapa Informática Agropecuária) ; Borro, L.C. (CNPTIA - Embrapa Informática Agropecuária) ; Jardine, J.G. (CNPTIA - Embrapa Informática Agropecuária) ; Neshich, G. (CNPTIA - Embrapa Informática Agropecuária) ; Tasic, L. (UNICAMP - Universidade Estadual de Campinas )

Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  inositolmonophosphatase 2 (IMPase 2), Hesperitin, Bipolar Disorder
[Abstract]



 C-002 - STRUCTURAL FEATURES AND MOLECULAR DOCKING OF 24-C-STEROL-METHYLTRANSFERASE FROM TRYPANOSSOMA BRUCEI
WERNECK K. (INMETRO - Grupo de Pesquisa em Biologia Computacional, Diretoria de Metrologia Aplicada às Ciências da Vida - Dimav, Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia - Inmetro, Duque de Caxias) ; Gomes D. E. B. (INMETRO - Grupo de Pesquisa em Biologia Computacional, Diretoria de Metrologia Aplicada às Ciências da Vida - Dimav, Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia - Inmetro, Duque de Caxias) ; Da Silva M. L. (INMETRO - Grupo de Pesquisa em Biologia Computacional, Diretoria de Metrologia Aplicada às Ciências da Vida - Dimav, Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia - Inmetro, Duque de Caxias) ; Visbal G. (INMETRO - Grupo de Química Medicinal, Diretoria de Metrologia Aplicada às Ciências da Vida - Dimav, Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia - Inmetro, Duque de Caxias)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  24-C-Sterol-Methyltransferase, Azasterol, Trypanossoma brucei
[Abstract]



 C-003 - INTERACTION BETWEEN A CD52 ANTIGEN’S MIMOTOPE AND CAMPATH-1H ANTIBODY’S SCFV: A STUDY BY MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION
Frota N.F. (FIOCRUZ-CE - Fundacao Oswaldo Cruz CearáUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Guimarães A. V. F. (FIOCRUZ-CE - Fundacao Oswaldo Cruz CearáUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Rebouças A. S. (FIOCRUZ-CE - Fundacao Oswaldo Cruz CearáUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Lourenzoni M. R. (FIOCRUZ-CE - Fundacao Oswaldo Cruz Ceará)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  scFv, Campath-1H, Molecular Dynamics
[Abstract]



 C-004 - UNVEILING THE EFFECT OF THE OXIDATION STATE IN THE FULLY-FOLDED LOCALLY-UNFOLDED TRANSITION OF HUMAN PEROXIREDOXIN 5: A MOLECULAR DYNAMICS STUDY
Portillo-Ledesma, S. (FCIEN, UDELAR - Facultad de Ciencias, Universidad de la RepúblicaFCIEN, UDELAR - Facultad de Ciencias, Universidad de la República) ; Vazquez, D. (UBA - Facultad de Farmacia y Bioquímica, Universidad de Buenos Aires) ; Santos, J. (UBA - Facultad de Farmacia y Bioquímica, Universidad de Buenos Aires) ; Ferrer-Sueta, G. (FCIEN, UDELAR - Facultad de Ciencias, Universidad de la República) ; Coitiño, E.L. (FCIEN, UDELAR - Facultad de Ciencias, Universidad de la República)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  peroxiredoxin 5, fully-folded locally-unfolded transition, accelerated molecular dynamics
[Abstract]



 C-005 - EVALUATION OF EMPIRICAL SCORING FUNCTIONS FOR VIRTUAL SCREENING DOCKING EXPERIMENTS
Pereira, F.S.S. (LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica) ; Guedes, I.A. (LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica) ; Dardenne, L.E. (LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  virtual screening, empirical scoring functions, binding affinity prediction
[Abstract]



 C-006 - PROTEIN-CARBOHYDRATE INTERACTIONS ASSESSED THROUGH MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS USING THE GROMOS FORCE FIELD
Pol-Fachin L (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; VERLI, H. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; LINS, R.D. (UFPE - Universidade Federal de Pernambuco)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  carbohydrate, glycan, glycoprotein
[Abstract]



 C-007 - DYNAMICS OF LIPID-LINKED, MEMBRANE SOAKED, OLIGOSACCHARIDES: BIOLOGICAL PRECURSORS FOR N-GLYCOSYLATION IN EUKARYA AND PROKARYA
Arantes P.R. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Pedebos, C. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Verli, H. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  LLO, N-glycosylation, molecular dynamics
[Abstract]



 C-008 - DEVELOPMENT OF BIOREMEDIATORS FOR HEAVY METAL-CONTAMINATED ENVIRONMENTS USING COMPUTATIONAL BIOLOGY ON SACCHAROMYCES CEREVISIAE PROTEINS
Figueiredo, R G A (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; DE MESQUITA, J. F. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  computational predictions, oxidative stress, SOD3
[Abstract]



 C-009 - PH AND AGGREGATION EFFECTS IN THE CONVERSION OF HUMAN PRION INTO SCRAPIE FORM: A STUDY USING MOLECULAR DYNAMICS WITH EXCITED NORMAL MODES
Scott L.P.B. (UFABC - Universidade Federal do ABC) ; Lima, A.N (UFTM - Universidade Federal do Triângulo Mineiro) ; Oliveria, R.J. (UFTM - Universidade Federal do Triângulo Mineiro) ; David, P. (ENS/CACHAN - Ecole Normale Supérieure de Cachan) ; Costa, M G S (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Molecular Dynamic, Normal Modes, Aggregation
[Abstract]



 C-010 - A SYNTHETIC BIOACTIVE PEPTIDE (MASTOPARANR1) WITH ANTIBACTERIAL ACTIVITY
Oshiro, K, G, N (UCDB - Universidade Católica Dom Bosco) ; Cardoso, M.H. (UCDB - Universidade Católica Dom BoscoUNB - Universidade de BrasíliaUCB - Universidade Católica de Brasília) ; Ribeiro, S.M. (UCDB - Universidade Católica Dom Bosco) ; Cândido, E.S. (UCDB - Universidade Católica Dom BoscoUCB - Universidade Católica de Brasília) ; Nolasco, D.O. (UCB - Universidade Católica de Brasília) ; Porto, W.F. (UCB - Universidade Católica de Brasília) ; Franco, O.L. (UCDB - Universidade Católica Dom BoscoUNB - Universidade de BrasíliaUCB - Universidade Católica de Brasília)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  antimicrobial peptide, biophysics, mastoparan
[Abstract]



 C-011 - GLYCOSIDE HYDROLASES PLANNING RESISTANT PRETREATING BIOMASS WITH IONIC LIQUIDS THROUGH MODELING COMPARATIVE AND MOLECULAR DYNAMICS
Fonseca,T.S ()
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  biofuel, Molecular Dynamics, ionic liquid
[Abstract]



 C-012 - INTERACTIONS BETWEEN IONIC LIQUIDS AND CELLULOSE FIBERS MONITORED BY MOLECULAR DYNAMICS
Stoque, RM (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia) ; Sant´Anna, C.B. (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia) ; Gomes, D.E.B. (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Biofuels, Cellulose, Molecular Dynamics
[Abstract]



 C-013 - MODELING AND MOLECULAR DYNAMICS OF THE CD20 RECEPTOR, MOLECULAR TARGET OF THE MONOCLONAL ANTIBODY RITUXIMAB
REBOUÇAS, A.S. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; FROTA, N.F. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; GUIMARÃES, A.V.F. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; LOURENZONI, M.R. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  CD20, Molecular Dynamics, Structural Stability
[Abstract]



 C-014 - DEVELOPMENT OF NEW INTEGRIN BETA 1 INHIBITORS BY MOLECULAR DOCKING AND DE NOVO RECEPTOR-BASED DESIGN
Vasconcelos, D.C.A. (FIOCRUZ/CE - Fundação Oswaldo Cruz) ; Rodrigues, B.L. (FIOCRUZ/CE - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Pinho, L.G. (FIOCRUZ/CE - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Caffarena, E.R. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Da Silva, J.H.M. (FIOCRUZ/CE - Fundação Oswaldo Cruz)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  de novo design, inhibitor, integrin
[Abstract]



 C-015 - NOVEL COMPOUNDS AS SELECTIVE INHIBITORS OF CASPASE-3: ORGANIC SYNTHESIS, IN SILICO AND IN VITRO EVALUATION
Minini, L (UDELAR - Universidad de la República, Facultad de CienciasUDELAR - Universidad de la República, Facultad de Ciencias) ; Hernandez, P (IIBCE - Instituto de Investigaciones Biologicas Clemente Estable) ; Lavaggi, ML (CUR - Centro Universitario de Rivera) ; Merlino, A (UDELAR - Universidad de la República, Facultad de Ciencias)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  caspase-3, aminothiazoles derivative, Alzheimer disease
[Abstract]



 C-016 - GROMOS53A6 FORCE FIELD PARAMETERS FOR CHALCONES AND FLAVONOIDS
John E.O. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Arantes, P.R. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Verli, H. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  chalcones, force field parameters, molecular dynamics
[Abstract]



 C-017 - EVOLUTION AND DYNAMICS OF THE N-GLYCOSYLATION PATHWAY THROUGH OLIGOSACCHARYLTRANSFERASES
Pedebos C. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Ligabue-Braun, R. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Arantes, P. R. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Verli, H. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Oligosaccharyltransferases, molecular dynamics, N-glycosylation
[Abstract]



 C-018 - MOLECULAR DYNAMICS OF SUPEROXIDE DISMUTASE 3
Pereira, G.R.C. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; De Mesquita, J.F (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  SOD3, computational predictions, oxidative stress
[Abstract]



 C-019 - PFN1 IN AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS – IN SILICO ANALYSIS, COMPUTATIONAL STRUCTURAL MODELING AND MOLECULAR DYNAMICS
Tellini, G.H.A.S (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; Pereira, G.R.C. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; De Mesquita J.F. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Amyotrophic Lateral Sclerosis, SNP, Profilin-1
[Abstract]



 C-020 - THEORETICAL MODELING OF SUBSTITUTIONS REACTIONS ON SELENURANES
Silva, G.D. (UFABC - Universidade Federal do ABC) ; Cunha; R. L. O. R (UFABC - Universidade Federal do ABC) ; Coutinho-Neto, M.D. (UFABC - Universidade Federal do ABC)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Chalcogenuranes, cysteine protease inhibitors, DFT
[Abstract]



 C-021 - DOCKING AND MOLECULAR DYNAMICS OF GLYCOSYL HYDROLASES FROM ACHATINA FULICA’S METAGENOME TO 2G ETHANOL PRODUCTION
Guimarães, M. (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e TecnologiaUFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro) ; Da Silva, M.L. (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia) ; Gomes, D.E.B (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Biofuels, Cellulase, Metagenome
[Abstract]



 C-022 - THE COMBINATION BETWEEN ARTIFICIAL INTELLIGENCE AND MOLECULAR DOCKING ON THE PREDICTION OF NATURAL SUBSTRATES PROTEINS
Dias M.F.R.(H2) (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia ) ; Chagas, M. S. (UFRJ - Universidade Federal do Rio de JaneiroINMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia ) ; da Silva, M. L. (INMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia ) ; Pascutti, P. G. (UFRJ - Universidade Federal do Rio de JaneiroINMETRO - Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia )
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  artificial Intelligence, molecular docking, physicochemical properties
[Abstract]



 C-023 - MODELING OF A SINGLE-CHAIN VARIABLE FRAGMENT AND ANALYSIS OF SCFV-EPITOPE INTERACTION: A MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION STUDY
Guimarães, A. V. F. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Frota, N. F. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Rebouças, A. S. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo CruzUFC - Universidade Federal do Ceará) ; Pessoa, C. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz) ; Lourenzoni, M. R. (FIOCRUZ - Fundação Oswaldo Cruz)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  scFv, Rituximab, Molecular Dynamics
[Abstract]



 C-024 - DEVELOPMENT OF EMPIRICAL SCORING FUNCTIONS FOR PREDICTING PROTEIN-LIGAND BINDING AFFINITY
Guedes I.A. (LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica) ; BARRETO, A.M.S. (LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica) ; MITEVA, M.A. (PARIS VII - Paris Diderot – Paris VII) ; DARDENNE, L.E. (LNCC - Laboratório Nacional de Computação Científica)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  binding affinity prediction, molecular docking, scoring functions
[Abstract]



 C-025 - SMGROMOS: A FORCE FIELD FOR DRUG DESIGN AND MEDICINAL CHEMISTRY
Polêto M.D. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Verli, H. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  molecular dynamics, drug design, GROMOS
[Abstract]



 C-026 - DYNAMICS OF THE COMPLETE MEMBRANE SOAKED HTLR4
de Aguiar, C. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul) ; Verli, H. (UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  TLR4, comparative modeling, molecular dynamics
[Abstract]



 C-027 - STRUCTURAL MODELING OF TREHALOSE SYNTHASES IN PATHOGENIC ORGANISMS
GONÇALVES, L.M. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; REBELLO, A.N (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; DE MESQUITA. J.F (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Trehalose, TPS1, binding site
[Abstract]



 C-028 - IN SILICO ANALYSIS OF HNRNPA1 IN AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS
Krebs, B.B. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; Oliveira, C.C.S. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro) ; De Mesquita, J.F. (UNIRIO - Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Amyotrophic Lateral Sclerosis, In silico, Molecular Dynamics
[Abstract]



 C-029 - ON THE CALCULATION OF REDOX POTENTIALS IN IRON-SULFUR PROTEINS
Teixeira, M. H. (IQ-USP - Instituto de Química da USP) ; Arantes, G. M. (IQ-USP - Instituto de Química da USP)
Presentation: Poster
Area: Computational Biochemistry and Biophysics
Keyword:  Computational Biochemistry, Linear response theory, Molecular dynamics
[Abstract]


 




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